Мавзолей Ходжи Данияра (Пророк Даниил) находится на северной стороне холма Афросиаб, рядом с целебным источником. Согласно легендам, Ходжа Данияр был сподвижником родственника Пророка Кусам ибн Аббаса в распространении ислама. Также сохранилось предание, что Ходжа Данияр — это коранический и библейский пророк Данияр (Даниил), чьи останки были привезены сюда Амиром Темуром.
Пророк Даниил почитается тремя мировыми религиями. Он один из четырёх великих израильских пророков в иудаизме.
Пророк Даниил был из знатного рода и являлся потомком Царя Соломона. Он жил в 4-5 веке до н.э. При завоевании Навуходоносором Иерусалима в 660 году до Р.Х. юный Даниил вместе с другими иудеями попал в вавилонский плен. Там 15-летнего Даниила и других самых способных юношей определили в школу для подготовки к службе при царском дворе.
После окончания занятий Даниил с тремя друзьями был определен на службу при царском дворе и здесь оставался в звании придворного сановника во все время царствования Навуходоносором и его пяти приемников. После покорения Вавилона он стал советником царей Дария и Кира персидского.
Бог наделил Даниила способностью понимать значение видений и снов, и эту способность он проявил, объяснив Навуходоносору два его сна, которые сильно смутили царя.
При Дарии Мидийском Даниил занял важный правительственный пост. Завидуя Даниилу, языческие вельможи оклеветали его перед Дарием и добились, чтобы Даниила бросили на съедение львам. Но Бог сохранил пророка невредимым. Разобрав дело, Дарий повелел клеветников Даниила повергнуть этой же казни, и львы моментально растерзали их.
В третий год царствования Кира в Вавилоне Даниил удостоился получить откровение о дальнейшей судьбе народа Божия и четырех языческих империй. Его пророческая книга состоит из 14 глав.
История указывает на два места захоронения Святого Даниила — сам Вавилон и город Сузы (в настоящее время город Шустер). Считается, что Тимур перевёз часть останков Даниила, а именно его руку, в Самарканд. Согласно преданию, лошадь, перевозившая останки, остановилась на этом месте и не желала двигаться дальше. От удара ее копыта вдруг забил целебный родник. Тогда Темур отдал приказ захоронить мощи святого именно здесь. Затем спустя годы могила вдруг начала расти, достигнув в длину 17 метров. В связи с этим в прошлом его гробница периодически достраивалась и удлинялась. В начале XX века над святым погребением был сооружен мавзолей с цепочкой куполов.
Рядом с Мавзолеем расположен водный источник с невероятно вкусной водой, которая является святой и каждый, кто захочет ступить к мавзолею, должен испить этой воды и омыть открытые места. Говорят, что вода из этого источника исцеляет не только тело, но и душу. За этой водой люди приезжают со всей Средней Азии. Место является объектом паломничества, как местных жителей, так и приезжающих со всего мира. В 1996 году, прибывший в Самарканд, Патриарх Всея Руси Алексий II навестил Мавзолей и освятил его. Говорят, что после освящения, близ Мавзолея снова зацвело фисташковое дерево, считавшееся засохшим. Как говорят местные жители можно загадать желания и завязать ленточку на этом древе и оно обязательно сбудется.