Комплекс Бахауддина Накшбанди был воздвигнут в честь покровителя Бухары — Шейха Бахауддина Накшбанди. Он родился в селении Касри Орифан (это более позднее название селения). Шейх Накшбанди получил духовное посвящение от Ходжи Абдухолик Гиждувани, который явился к нему во сне и велел стать учеником Амира Куляла. Другим его учителем был правитель-суфий чингизид Султан Халил.

Шейх Бахауддин Накшбанди был духовным наставником Амира Темура. В молодости Накшбанди был ткачом. В будущем он станет покровителем ремесел. Поклонение святой могиле шейха приравнивалось совершению своеобразного хаджа в Мекку.

Мемориальный комплекс Бахауддина Накшбанди создавался на протяжении пяти столетий. Его центром является прямоугольный двор, где находится погребение шейха. Ко двору примыкают поминальные мечети XIX века. По периметру двора сооружен современный айван с деревянными колоннами. У входа в него находится некрополь шейбанидских правителей, где погребены Искандерхан и его сын Абдуллахан II. Самым крупным зданием мемориала является ханака с мощным купольным перекрытием.

В 80-х годах комплекс был отремонтирован и сегодня включает: отдельный дворик с хаузом, расписными мечетями Кушбеги и Музафархана, минарет, небольшое медресе, дахму над могилой святого и усыпальницу бухарских правителей.